מבשלת קרלסברג הוקמה בשנת 1847 על ידי יאקוב יאקובסן, בקופנהאגן- דנמרק; ושם נמצא עד היום הסניף הראשי של המבשלה.
המבשלה נקראת על שמו של יאקוב- קארל.
בשנת 1875 הוקמה בסמוך למבשלה מעבדה לחקר הכימיה של הבירה, ובה בודד זן שמרי הלאגר הנמצא בשימוש הפופולארי ביותר כיום- Saccharomyces carlsbergensis.
